Wenn Morbus Buerger diagnostiziert wird, ist die einzige definitive Behandlung eine Sympathektomie. Die wichtigste davon ist die Entfernung eines winzigen Nervensystems aus dem Bauch, die sogenannte lumbale Sympathektomie. Bei diesem Nervensystem handelt es sich um das Nervensystem, das nur bei kaltem Wetter eine Kontraktion der Fußvenen zulässt. Es handelt sich nicht um ein Geh-, Lauf- oder irgendein motorisches Neuronensystem oder in irgendeiner Weise um ein sensorisches Nervensystem. Wenn das Gleiche auch an den Händen passiert, wird an den Händen eine Sympathektomie, eine sogenannte Thoraxchirurgie, durchgeführt. Ebenso wird das Nervensystem entfernt, das die winzigen Muskeln zu den Händen kontrahiert, und der Patient profitiert zu 70–80 Prozent ohne Komplikationen.
Bei der Behandlung der Buerger-Krankheit ist es äußerst wichtig, mit dem Rauchen so schnell wie möglich aufzuhören.